运输公司通常包括以下科室：
董事会秘书处：
负责董事会的日常事务和文件管理。
监事会秘书处：
负责监事会的日常事务和文件管理。
总经理办公室：
负责公司的日常运营和总经理的日常工作。
综合办公室：
负责公司综合事务和协调各部门工作。
运营科 （或叫经营管理科）：负责公司的运营管理和业务拓展。人力资源部：
负责员工的招聘、培训、绩效评估等人力资源管理工作。
财务部：
负责公司的财务管理和会计核算工作。
物资科：
负责公司物资的采购、存储和分发。
工程技术科：
负责公司工程项目的技术支持和管理工作。
水运科：
负责水上运输的管理和运营。
安全科（或叫安全培训中心）：负责公司的安全生产和应急管理工作。
市场营销科：
负责公司的市场推广和营销活动。
渠道管理科：
负责公司销售渠道的建设和管理工作。
后勤保障科：
负责公司的后勤保障和物资供应工作。
调度室：
负责公司的运输调度和车辆管理工作。
航线部：
负责公司航线的规划和管理工作。
市场部：
负责市场调研和客户需求分析。
销售部：
负责公司的销售和客户服务工作。
操作部：
负责具体的物流操作和运输管理工作。
经理室：
负责经理层的日常工作和决策支持。
这些科室的设置可能因公司的规模、业务类型和管理模式的不同而有所调整。建议根据公司的实际情况和需求，合理设置和调整科室，以提高公司的运营效率和管理水平。
